蜜丸的制法基本步驟如下：煉蜜→合藥→制條→成丸→包裝→貯存。　
　
1、對蜂蜜的選擇與煉制是保證蜜丸質量的關鍵。煉蜜的目的是除去雜質，破壞酵素，殺死微生物，蒸發水分，增強粘性。其方法是：小量生產可用銅鍋或鍋直火加熱，文火煉；大量生產可用蒸汽夾層鍋，減壓蒸發濃縮鍋進行煉制，最后濾除雜質。
煉蜜的程度分為嫩蜜、煉蜜、老蜜三種。　　
嫩蜜：適合用于多量油質，粘液質，糖類及動物組織等的藥物制丸。　　
中蜜：適合用于纖維質，淀粉及含部分油脂，糖類，一般性制丸。　　
老蜜：適合用于含多量纖維質及粘性差的礦物質藥物制丸。　　
2、將已煉制好的煉蜜與藥粉按比例進行混合(藥粉與煉蜜的比例一般為1：1或1：5也有不足1：1的，要根據藥物性質及季節不同而異。一般含糖類、油脂類的中草藥用蜜少。含纖維素較多和質地疏松的藥物用蜜量多。夏季用蜜量少，冬季用蜜量多。均勻地揉合，做成像面團樣丸塊。合藥時，蜂蜜一般趁熱加入(如含有膠質，樹脂或揮發性成分需待煉蜜稍冷后再加入混合)，充分和勻，使其內外全部滋潤，色澤一致，軟硬適中，能隨意捏塑即可。　　
3、將合好的面團樣軟材放置一定時間，使藥料與蜂蜜成分混合滋潤，并產生一定粘性后即可用全自動制丸機制丸，做出的藥丸大小均勻，顆粒圓滑、飽滿等。(小量生產時可用小型制丸機。)　　
4、制丸時， 為避免藥團粘手和粘器具，操作時可用適量的潤滑劑。潤滑劑可用甘油或麻油(花生油)，蜂蠟按一定比例 ，加熱熔化而成。夏季蜂蠟可適當多加一點。　　
5、包裝與貯藏：制成的蜜丸，可采用蠟紙、玻璃紙、塑料袋、蠟殼包好貯存于陰涼干燥處。(注：不可把做好的藥丸放在太陽底下暴曬。)